17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0144 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
379 aa  757    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6072  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.76 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.32 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
288 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  23.05 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.55 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  22.89 
 
 
219 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 
278 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.27 
 
 
302 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  20.96 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.96 
 
 
293 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  23.21 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  21.76 
 
 
307 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  22.5 
 
 
298 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  22.5 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 
317 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>