More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1692 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  82.94 
 
 		 298 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  83.33 
 
 		 298 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  82.27 
 
 		 298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  72.63 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  71.58 
 
 		 292 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  56.58 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  68.95 
 
 		 219 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.26 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  43.38 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.77 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  29.35 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  28.21 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  26.64 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1509  hypothetical protein  76.47 
 
 		 82 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.585476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.77 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  26.39 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  26.39 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  26.04 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  26.07 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.34 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  27.21 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  25.09 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.35 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.02 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.86 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.96 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  27.15 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.94 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.86 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.96 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.3 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27.74 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.65 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  25.86 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.36 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  30.51 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  29.92 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  25.18 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  25.18 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.19 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  25.9 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.99 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.42 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  23.21 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.27 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.94 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  30.26 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.19 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  27.15 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2715  hypothetical protein  23.16 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  26.3 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.67 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  25.08 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2583  hypothetical protein  26.23 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00791641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  26.3 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  26.3 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  30.1 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  26.3 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.73 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  25.25 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1578  integral membrane protein  23.16 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2630  integral membrane protein  23.16 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  25.56 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  25.93 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  25.93 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  23.08 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.09 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  25.59 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.71 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  26.14 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.09 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.67 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  29.61 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  27.41 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  22.76 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2396  hypothetical protein  67.5 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  24.66 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  24.56 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  23.62 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.35 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  24.56 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  24.52 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>