164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4824 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 306 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  92.81 
 
 		 306 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  84.46 
 
 		 307 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.67 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  39.25 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  39.86 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  39.74 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  39.53 
 
 		 300 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  39.53 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  40.4 
 
 		 343 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  41.36 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  40.07 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  41.08 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  40.82 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  39.65 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.19 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  39.86 
 
 		 300 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  41.91 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.44 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.01 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  38.28 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.44 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  41.22 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  40.2 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  34.56 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  40.93 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  37.41 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  38.95 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  35.14 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  35.14 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  38.93 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  39.18 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  38.46 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  39.78 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  38.46 
 
 		 255 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.15 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  36.24 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  30.6 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  36.5 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  31.18 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  31.18 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  31.41 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  30.82 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  31.94 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  31.05 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.16 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  31.05 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.8 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  29.09 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  28.32 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  28.41 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  35.23 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  30.43 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  26.97 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.31 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.11 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  26.47 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  25.84 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  28.93 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  25.91 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  28.92 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.68 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  28.06 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  27.11 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.93 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  26.03 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.91 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  25.17 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  29.76 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.46 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  27.75 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  23.69 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  24.81 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  21.99 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  28.36 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.36 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.26 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  28.36 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.5 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  23.79 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  23.87 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.98 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.45 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.14 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  26.62 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  23.74 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.08 
 
 		 308 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  27.32 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>