218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4343 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 300 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  92.33 
 
 		 300 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  67.33 
 
 		 302 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.27 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.27 
 
 		 300 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  66.33 
 
 		 298 aa  362  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  68.53 
 
 		 304 aa  352  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  63.95 
 
 		 307 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  63.95 
 
 		 307 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  62.59 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  64.41 
 
 		 298 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  62 
 
 		 299 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  56 
 
 		 301 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  56.6 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  56.6 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  55.05 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  56.25 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  57.44 
 
 		 512 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  62.76 
 
 		 308 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  56.01 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  57.64 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  57.29 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  55.41 
 
 		 306 aa  291  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  57.29 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.25 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  61.02 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  54.51 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  63.49 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  55.21 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  56.75 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  54.34 
 
 		 272 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.07 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  40.27 
 
 		 312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  45.58 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.15 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  36.04 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  35.06 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  28.47 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  29.2 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  29.2 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.29 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  29.67 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.83 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.83 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  28.83 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.68 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  31.05 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.33 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  29.86 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  39.06 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.1 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  32.12 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  32.1 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  33.09 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.36 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  24.5 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  32.35 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.7 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  25.94 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.41 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  24.91 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.69 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  23.76 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.9 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.25 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.25 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25.71 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5928  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  27.72 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  30.09 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.1 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  23.76 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  25.96 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  23.4 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  23.6 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30.88 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.23 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.9 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.37 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.35 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.37 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  23.97 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.37 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  28.87 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  22.49 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  22.49 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  23.75 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  23.46 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  29.73 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25.81 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  30.59 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>