211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30790 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  89.26 
 
 		 299 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  73.79 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  70.57 
 
 		 298 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  72.76 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  72.76 
 
 		 307 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  72.82 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  71.38 
 
 		 298 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  61.87 
 
 		 302 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.89 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.89 
 
 		 300 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  61.48 
 
 		 304 aa  309  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.92 
 
 		 300 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  55.21 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  55.21 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  54.86 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  53.69 
 
 		 301 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  56.12 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  53.61 
 
 		 318 aa  282  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  56.69 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  53.66 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  56.34 
 
 		 512 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  56.34 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  54.86 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  60.36 
 
 		 304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.21 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  53.12 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  59.5 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  53.47 
 
 		 300 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.03 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  52.92 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0416  hypothetical protein  40.73 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.08 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  41.34 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  44.91 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  38.72 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  30.07 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.92 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3334  hypothetical protein  40.26 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.9 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  27.37 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  27.37 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.04 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  27.34 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.1 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.06 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  27.94 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  27.01 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.01 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  31.48 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  26.28 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.24 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.11 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  31.36 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  25.95 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.91 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.69 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1184  hypothetical protein  25.93 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432644  normal  0.172566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  24.91 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.05 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  27.68 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  26.64 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  30.81 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  30.81 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  29.48 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.54 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  24.92 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  29.92 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  25.65 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  23.53 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  26.15 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  26.15 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.73 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  26.15 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.7 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  22.99 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.85 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  25.37 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  27.49 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2851  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.54 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  25.98 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  23.43 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.63 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3614  integral membrane protein  26.8 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  28.16 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  27.98 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.08 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  25.7 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>