107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0563 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  636    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  75.97 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  75 
 
 		 310 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  30.99 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  27.93 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  25.62 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  26.42 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  30.43 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  29.08 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27.21 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  28.06 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  24.32 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  27.56 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  23.53 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  25.09 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  28.85 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.39 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  24.36 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  24.36 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  25.69 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  26.09 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  26.09 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  31.25 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  24.36 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  24.36 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.62 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  24.7 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  23.86 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.27 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.93 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  22.97 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  22.97 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.77 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  28.44 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  22.76 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  27.21 
 
 		 281 aa  52.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  27.21 
 
 		 281 aa  52.8  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  23.4 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  26.37 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  23.4 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  30.43 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  30.98 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.93 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  25.22 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  24.14 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.4 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  28.36 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  24.7 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.2 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  25.75 
 
 		 304 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  30.43 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  29.03 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  24.72 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  22.18 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.95 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.65 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  23.1 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  24.82 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  29.03 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  23.72 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  29.03 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  32.03 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  21.48 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  22.15 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.04 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  25.2 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.11 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  25.25 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  22.7 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  26.24 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  23.28 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  27.74 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  28.39 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  22.97 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  22.73 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  27.84 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  24.15 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  28.82 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.44 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1524  hypothetical protein  37.66 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00012311  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1317  hypothetical protein  37.66 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000164006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>