More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1257 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  511  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  47.43 
 
 
310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  43.35 
 
 
308 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.42 
 
 
295 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  42.09 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  42.86 
 
 
305 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.13 
 
 
302 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 
302 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 
307 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  38.18 
 
 
300 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.64 
 
 
298 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  37.96 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  37.82 
 
 
297 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 
305 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.65 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  42.75 
 
 
316 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.29 
 
 
300 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.09 
 
 
300 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.1 
 
 
302 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  33.95 
 
 
294 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  33.95 
 
 
294 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  38.63 
 
 
300 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  33.95 
 
 
294 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  33.95 
 
 
294 aa  141  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  34.32 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  46.47 
 
 
318 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  33.58 
 
 
295 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.88 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.88 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  33.7 
 
 
286 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.89 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  42.74 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  36.43 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  36.36 
 
 
283 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  32.61 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  30.25 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.78 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  30.71 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  34.32 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.23 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  30.71 
 
 
309 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  33.58 
 
 
295 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  30.36 
 
 
303 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  30.36 
 
 
303 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  30.36 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  30.36 
 
 
303 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  29.86 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  30 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  29.64 
 
 
303 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  30 
 
 
303 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.27 
 
 
286 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  42.34 
 
 
285 aa  119  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  42.5 
 
 
285 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.17 
 
 
284 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  33.09 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  38.28 
 
 
286 aa  112  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.4 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 
295 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  39.15 
 
 
306 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 
290 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.96 
 
 
301 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.82 
 
 
317 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  40.34 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.87 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  37.69 
 
 
304 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.2 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  38.46 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  30.71 
 
 
299 aa  86.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  31.64 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  28.24 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  30.36 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  30.36 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.57 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  27.34 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.77 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  31.51 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.98 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.24 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  28.78 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  26.45 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.91 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  28.94 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.37 
 
 
314 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.7 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.52 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  33.68 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.33 
 
 
292 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  26.62 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  31.15 
 
 
304 aa  62.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  27.91 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  26.62 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  29.63 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  27 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>