103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4761 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  621  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  34.38 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  35.23 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  35.23 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.1 
 
 
328 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  37.23 
 
 
281 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5204  hypothetical protein  38.66 
 
 
325 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 
301 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  35.17 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  31.79 
 
 
296 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  30.11 
 
 
294 aa  89.4  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  33.11 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  30.63 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  25.09 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  31.44 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.25 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.51 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
325 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  25.86 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  29.58 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  26.58 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  26.58 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  27.52 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  25.95 
 
 
302 aa  56.6  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.2 
 
 
290 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  30.49 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  27.21 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.38 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  22.71 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  28.52 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.9 
 
 
308 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  26.57 
 
 
322 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  29.54 
 
 
292 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.72 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  31.54 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  30.85 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 
300 aa  49.3  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.05 
 
 
299 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  33.46 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  27.56 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.65 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  34.29 
 
 
329 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  32.23 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.62 
 
 
274 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  25.81 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.65 
 
 
308 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  25.45 
 
 
273 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  25.71 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  31.6 
 
 
290 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.74 
 
 
298 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  39.44 
 
 
314 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  27.78 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  30.21 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  25.64 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  27.83 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  27.83 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.5 
 
 
284 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2149  hypothetical protein  25.6 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.26965  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  27.78 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4399  hypothetical protein  40.35 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.2 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  33.06 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  33.83 
 
 
294 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.46 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  27.84 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  27.36 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.05 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  27.87 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  27.05 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.11 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  28.47 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.05 
 
 
334 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>