209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0627 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  70.81 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.75 
 
 		 317 aa  178  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  46.67 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.94 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.24 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.93 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  47.29 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  34.98 
 
 		 347 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  34.67 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  39.16 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  42.86 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  33.92 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  37.76 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  32.49 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  38.55 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.4 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  36.55 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  35.02 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.21 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.27 
 
 		 381 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.86 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.93 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  36.56 
 
 		 323 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  35.34 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  32.76 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  28.32 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  35.34 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  39.74 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  28.09 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  32.3 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  30.96 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.98 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  35.42 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.9 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.71 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.86 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  32.84 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.86 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.86 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.86 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.79 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.86 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  31.5 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.58 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.41 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  24.29 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.56 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.62 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  22.22 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.82 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  26.58 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  26.58 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.58 
 
 		 307 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.69 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.58 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.58 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.58 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  31.85 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.97 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  27.46 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  33.54 
 
 		 310 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  30.93 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.39 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.85 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.21 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  32.82 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.89 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.08 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  31.74 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  25.36 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  31.71 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>