138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2447 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 321 aa  607  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  39.65 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.64 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  35.99 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.52 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  25.95 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  24.67 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  27.18 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  25.26 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  25.41 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  25.41 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  25.41 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  25.41 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  25.49 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  25.57 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  25.82 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  24.26 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  26.23 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  25.82 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  25.62 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  28.15 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  31.18 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.22 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  27.97 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.16 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  27.78 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  22.51 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  22.51 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.36 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  22.51 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  22.51 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.36 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  28.07 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.72 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.3 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.13 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  22.15 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.17 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  22.49 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  25.9 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  22.49 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  24.71 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  27.5 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 307 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  24.81 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.42 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  27.54 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.41 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  28.94 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.41 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.01 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  26.15 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  30.77 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  26.15 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.35 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  26.12 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  27.94 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.76 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  29.02 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  25.23 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  31.08 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  20.74 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  23.47 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  32.43 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  23.94 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.89 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  26.35 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  31.76 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.77 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  24.78 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  25.81 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  22.81 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  20.48 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  32.53 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  23.94 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.27 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  24.9 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  24.45 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  20.48 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.78 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>