More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0281 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
297 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.17 
 
 
301 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  71.53 
 
 
281 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  59.12 
 
 
299 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  60.22 
 
 
281 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  60.22 
 
 
281 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
325 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.99 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  32.53 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5204  hypothetical protein  39.93 
 
 
325 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
315 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  34.59 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  38.18 
 
 
332 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  31.43 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  30.17 
 
 
297 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
295 aa  102  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  30 
 
 
294 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
302 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.45 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  26.71 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  26.71 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  26.71 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  26.71 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  30.77 
 
 
322 aa  95.5  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  26.52 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  25.99 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  30.94 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 
300 aa  89  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  30.34 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  27.08 
 
 
295 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  25.99 
 
 
296 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  29.58 
 
 
305 aa  85.5  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  26.5 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  29.39 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  27.17 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  28.98 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  34.19 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.73 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  29.51 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  29.55 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  30.58 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.49 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  31.27 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  25.64 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  29.64 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  26.48 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.2 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  31 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.48 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  27.15 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  26.87 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  26.2 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.2 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.2 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  26.2 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.2 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.23 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.2 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  28.06 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  27.8 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  27.34 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  30.64 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  27.24 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  28.65 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  26.52 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.69 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  34.71 
 
 
277 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.85 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  30.24 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  26.43 
 
 
298 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  30.05 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  28.91 
 
 
365 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  27.97 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  26.92 
 
 
293 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.68 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 
295 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>