73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4083 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 295 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  46.5 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  47.5 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  39.07 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  36.49 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  38.67 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  31.71 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  31.21 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  29.17 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.52 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  27.12 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  32.21 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  31.42 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  29.24 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  29.29 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  32.39 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  27.13 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  27.3 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  32.25 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  30.27 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  30.27 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.54 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  28.46 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 328 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.26 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  26.51 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.6 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  33.46 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.68 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.29 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 329 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  26.55 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  24.26 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  28.46 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  32.19 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.56 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  29.52 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  26.1 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  21.33 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  19.29 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  25.72 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  26.07 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02208  hypothetical protein  24.52 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  25.51 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  30.33 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.17 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  29.83 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  22.22 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  27.02 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  18.9 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  29.33 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  23.55 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  24.91 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  29.85 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  31.43 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  27.16 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  23.32 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27 
 
 		 397 aa  42.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  23.55 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.55 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>