74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2448 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  603  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  45.36 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  32.56 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  32.39 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  32.5 
 
 		 281 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  32.03 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  32.03 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 328 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  31.54 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5204  hypothetical protein  32.32 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  24.53 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  25.44 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  25.71 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  28.72 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.42 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  27.18 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  27.99 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  27.46 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.03 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  33.1 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.06 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.32 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  28.95 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  21.74 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  28.94 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  26.04 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  31.21 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  30.61 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  22.53 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.75 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  25.09 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.43 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  22.53 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.38 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  28.21 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  23.72 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.37 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  22.13 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  22.53 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  22.53 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  22.13 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.14 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  22.83 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 297 aa  45.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  21.65 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  20.82 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  21.72 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  21.16 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  22.13 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  21.72 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  27.87 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  21.72 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  21.23 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  20.89 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  21.72 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.36 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.37 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>