29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0335 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  38.75 
 
 
353 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  41.87 
 
 
319 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 
334 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.64 
 
 
295 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  35.59 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  30.17 
 
 
316 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  27.99 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.24 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  26.42 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  26.96 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  24.07 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  31.21 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
301 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  31.3 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  27.57 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  29.63 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  25.61 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.79 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  27.89 
 
 
332 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.54 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  27.04 
 
 
287 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  25.9 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  23.86 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.49 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  24.39 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>