87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0547 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.25 
 
 		 334 aa  318  7e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  59.6 
 
 		 353 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  41.87 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.54 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  36.97 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  38.08 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  30.99 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  31.23 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  31.23 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 		 294 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  30.96 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27.99 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  27.13 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.02 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  29.78 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  30.34 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.41 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  30.34 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  30.34 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 290 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  27.12 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6312  hypothetical protein  30.11 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.05 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  30.42 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  30.42 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  28.52 
 
 		 281 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22136  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  25.79 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  29.41 
 
 		 512 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0331  hypothetical protein  26.7 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  26.96 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  29.41 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2873  hypothetical protein  26.7 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  25.16 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  28.98 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.24 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.07 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3010  hypothetical protein  26.7 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  27.78 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  27.84 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  29.32 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  25.16 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  31.18 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  25.16 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  26.79 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.87 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  26.9 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  27.85 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  25.16 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  25.16 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  28.1 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  28.57 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  25.74 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  27.11 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  26.47 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  27.23 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0435  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  29.61 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  25.54 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  25.16 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.14 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  27.11 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  24.58 
 
 		 325 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>