144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5965 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 328 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5204  hypothetical protein  84.62 
 
 		 325 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  53.66 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  41.55 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  37.79 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  37.15 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  37.15 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  32.86 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  37.14 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  33.22 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  26.87 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  37.68 
 
 		 330 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  24.04 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  24.11 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.91 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  23.57 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  23.57 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.57 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  23.57 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  30.65 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  23.05 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  30.62 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  29.84 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  29.84 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.7 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  24.05 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  23.53 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.64 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  33.98 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  23.76 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  31.88 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.73 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  28.19 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.74 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  28.46 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  26.1 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  29.29 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  30 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  27.66 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  29.39 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  25.09 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  34.69 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  30.06 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  28.94 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.92 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  22.8 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  22.39 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  33.88 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.63 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  22.8 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.86 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  30.15 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  32.86 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  26.43 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.4 
 
 		 294 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  23.6 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  28.96 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.73 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.98 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  30.95 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  33.11 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  27.67 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  22.8 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  24.83 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  28.81 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.88 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  31.63 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.18 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  30.43 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  27.89 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.34 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 317 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  28.65 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  28.97 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  25.81 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30.22 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  22.4 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.88 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>