92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0090 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  45.36 
 
 
311 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  30.3 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  35.34 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  32.28 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  32.28 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5204  hypothetical protein  32.45 
 
 
325 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.25 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.88 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  32.46 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  25.33 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  31 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.03 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  23.53 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  25.42 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  25.27 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3122  hypothetical protein  25.78 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4761  hypothetical protein  29.89 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  21.51 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  23.31 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  23.81 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.37 
 
 
290 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.52 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  23.29 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  26.44 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  24.15 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.23 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  29.71 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  22.03 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.72 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
334 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  24.66 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  29.56 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  21.03 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.77 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  21.03 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.27 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  21.03 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  20.98 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.16 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  22.02 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  21.03 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  21.55 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  27.31 
 
 
353 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  21.03 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  27.56 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  21.11 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.85 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  29.38 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  24.7 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  23.42 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  21.11 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.97 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  21.59 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.87 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  24.71 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  20.74 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  20.74 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  20.74 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  20.45 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  20.37 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.76 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  20.74 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  26.55 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  20.37 
 
 
303 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  19.7 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  29.12 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  23.73 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  21.33 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.73 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  27.8 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  41.38 
 
 
281 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  27.8 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  27.8 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 
530 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  17.05 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  23.27 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  25.28 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  24.07 
 
 
298 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.48 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  31.88 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>