62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0809 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.03 
 
 		 295 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.03 
 
 		 293 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  36.97 
 
 		 301 aa  148  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  36.17 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  34.58 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  30.64 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  26.91 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  29.77 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  26.6 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  28.34 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  30.98 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  23.26 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  28.12 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  26.75 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  27.4 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  27.27 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  22.26 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4385  EamA family protein  26.67 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0475  transporter, EamA family  27.08 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.701719  hitchhiker  3.82339e-16 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04860  membrane protein  25.21 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.14 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4549  EamA family protein  26.67 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4903  eama family protein  26.67 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4760  transporter, EamA family  27.08 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  27.31 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4788  EamA family protein  27.69 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4395  EamA family protein  26.67 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4786  transporter, EamA family  26.67 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  27.1 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  26.29 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  27.62 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  22.27 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  28.65 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  25.47 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  27.53 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4769  transporter, EamA family  26.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  26.29 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  26.29 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.97 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  27.53 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.92 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  28.09 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  27.53 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  32 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  26.29 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  26.29 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  24.73 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  24.65 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  22.57 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  24.88 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>