39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2581 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  46.15 
 
 
301 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  35.94 
 
 
300 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  30.82 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.02 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  33.45 
 
 
293 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 
285 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  33.83 
 
 
297 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  32.3 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  33.07 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.09 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  28.68 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  26.52 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  21.97 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  24.24 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.92 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  29.45 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  28.46 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  26.77 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  31.58 
 
 
332 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  26.91 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  27.41 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  29.62 
 
 
294 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  30.56 
 
 
327 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  30.37 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  30.37 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.24 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  25.77 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>