47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2138 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  541  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  73.93 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.2 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  72.5 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  69.89 
 
 		 291 aa  355  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.33 
 
 		 294 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  70.61 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  57.84 
 
 		 297 aa  300  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  62.5 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  32.3 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  30.97 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  31.33 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  27.31 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  28.79 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.36 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  31.25 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.11 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  27.76 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.07 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.25 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  31.16 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  21.58 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  22.86 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  30.69 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  37.21 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  33.04 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  26.5 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  42.86 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.73 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.37 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  25.44 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  25.76 
 
 		 295 aa  42.7  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2308  hypothetical protein  28.21 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  22.58 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.65 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.28 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>