116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4912 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  100 
 
 		 298 aa  594  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  42.24 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  30.82 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  32.52 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  30.24 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  27.47 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  29.64 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  33.81 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.35 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  26.95 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  27.49 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  20.97 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  26.38 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  27.11 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  27.45 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  24.88 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  29.22 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  24.7 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  28.7 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  25.73 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  24.15 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.18 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24.15 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  27.04 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  22.82 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.24 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.24 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  25.51 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.02 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  27.6 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.92 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  26.87 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  25.94 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.76 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  30.94 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  26.26 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  28.23 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  27.72 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  26.98 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.35 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.22 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.23 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  23.94 
 
 		 345 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7485  hypothetical protein  25.08 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148993  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  23.08 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  33.04 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  40.91 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.38 
 
 		 397 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.51 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  26.56 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  22.26 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.08 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  23.83 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  24.03 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  23.83 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.36 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.61 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.77 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.74 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.83 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  23.68 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  23.68 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.74 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  23.68 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.89 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  23.83 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.94 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  23.87 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.38 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.77 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  26.29 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  28.16 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  27.35 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>