209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001539 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001539  permease  100 
 
 		 292 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  83.51 
 
 		 292 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  57.99 
 
 		 290 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0663  integral membrane protein, putative transmembrane transporter  59.27 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  60.38 
 
 		 287 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3252  hypothetical protein  46.62 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2711  hypothetical protein  46.74 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2149  hypothetical protein  41.13 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.26965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  40.5 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.01 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1683  hypothetical protein  34.01 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  28.88 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  28.35 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  28.04 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  27.24 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  27.81 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  28.31 
 
 		 309 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  24.29 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  28.06 
 
 		 295 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 312 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  27.56 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  28.52 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  28.12 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  27.96 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  27.6 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  27.73 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  27.73 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  27.73 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  26.5 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  27.34 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  27.34 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  27.34 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  27.73 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.07 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.14 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.29 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  29.44 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  27.51 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  25.84 
 
 		 298 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  25.27 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  25.63 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.09 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  24.73 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  25.65 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  29.48 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  24.32 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  26.74 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  28.9 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  24.07 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  25.09 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  29.07 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  25.94 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  28.68 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  23.97 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  24.19 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  27.54 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  25.78 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  25.5 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  23.63 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  30.71 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2982  DMT family permease  29.15 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  22.01 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  27.23 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  25.99 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  20.85 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  26.17 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  24.64 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  20.85 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  28.46 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  26.24 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  24.16 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  29.43 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  25.65 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  23.23 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>