115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2711 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2711  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2149  hypothetical protein  65.36 
 
 		 281 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.26965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3252  hypothetical protein  59.8 
 
 		 303 aa  352  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  46.74 
 
 		 292 aa  238  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  46.21 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  45 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  45.98 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0663  integral membrane protein, putative transmembrane transporter  43.68 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  32.27 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1683  hypothetical protein  29.45 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  29.02 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  24.91 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.49 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  23.23 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  22.01 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  23 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  22.01 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  27.23 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.18 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  24.83 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  22.22 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  21.37 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  25.51 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.56 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  25 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  22.47 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.78 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  23.36 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.62 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  23.26 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  25.13 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  25.67 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  24.18 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  23.58 
 
 		 293 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.71 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.2 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  20.6 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  21.17 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  21.88 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  22.02 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  22.15 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.5 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  21.99 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  24.26 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  24.26 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  30.67 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  21.88 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  21.63 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  22.94 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  22.7 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  24.83 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  21.93 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.93 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  21.53 
 
 		 301 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.93 
 
 		 308 aa  48.9  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  24.23 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  21.08 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.99 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  25.29 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  21.08 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  21.72 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  21.08 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  21.08 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  21.93 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  24.81 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  25 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  20.94 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  23.31 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  23.36 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  23.88 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  19.87 
 
 		 322 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  19.78 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  19.78 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  23.93 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  19.78 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  25.12 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.14 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  21.14 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  20.85 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  23.57 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  22.06 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  27.18 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.63 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  22.26 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.16 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>