186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3252 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3252  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2711  hypothetical protein  60 
 
 		 300 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2149  hypothetical protein  61.92 
 
 		 281 aa  351  8e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.26965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  47.54 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  46.62 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  46.37 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  47.49 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0663  integral membrane protein, putative transmembrane transporter  45.77 
 
 		 288 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  35.14 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.07 
 
 		 301 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1683  hypothetical protein  33.12 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.12 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  27.33 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  26.67 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  27 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  27 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.25 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  27 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  27 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  27 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  24 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  27 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  26.67 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  25.91 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  26.3 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  23.27 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  23.48 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  24.14 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  25.38 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  24.45 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  22.99 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  25.35 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  22.99 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  21.64 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  22.57 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  25.58 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  24.52 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.34 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.18 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  22.18 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  23.45 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  22.75 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  22.99 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  22.12 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  22.18 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  23.53 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  23.74 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.96 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  21.21 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  24.66 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  23.16 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.2 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  24.84 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  24.31 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  22.81 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  23.05 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  22.81 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  26.56 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  24.65 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.98 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  23.02 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  22.5 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  24.2 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  23.84 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  25.1 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.54 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.91 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  22.03 
 
 		 335 aa  53.5  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  23.86 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  21.92 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  23.86 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  23.86 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  23.76 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  23.44 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  25.58 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.46 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  21.66 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  24.09 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  26.14 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>