178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0663 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0663  integral membrane protein, putative transmembrane transporter  100 
 
 		 288 aa  569  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  82.87 
 
 		 290 aa  484  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  69.86 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  61.25 
 
 		 292 aa  334  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  59.27 
 
 		 292 aa  325  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3252  hypothetical protein  45.77 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.3 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2711  hypothetical protein  43.68 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  38.11 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2149  hypothetical protein  39.38 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.26965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1683  hypothetical protein  33.45 
 
 		 319 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  28.22 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  28.22 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  28.22 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  28.22 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  27.86 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  28.22 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  28.22 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  27.87 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.48 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.79 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 295 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  28.26 
 
 		 295 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  28.26 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  22.18 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  26.12 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  24.45 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  24.18 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  24.14 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  25.78 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  26.49 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  23.23 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  28.34 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  24.91 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  24.34 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  23.97 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.53 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  25.77 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.71 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  24.32 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  24.63 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  24.81 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  26.07 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  24.91 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  22.38 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  26.55 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  25.19 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.43 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.43 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  26.28 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  23.31 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  27.07 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  26.59 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  25.75 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  25.6 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  24.44 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.13 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  22.95 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  26.01 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.19 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  22.61 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  26.34 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  22.86 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  27 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.72 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  22.61 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  24.91 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  26.72 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  26.25 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  25.6 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  23.57 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  24.72 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  25.17 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.34 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  25.95 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  22.87 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.38 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  25.85 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  24.16 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  24.16 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.91 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>