184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0274 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  100 
 
 
267 aa  525  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  43.12 
 
 
299 aa  149  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  38.53 
 
 
312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.24 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.4 
 
 
295 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  36.4 
 
 
295 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  40 
 
 
295 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  36.4 
 
 
295 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  39.57 
 
 
302 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.06 
 
 
294 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  39.13 
 
 
295 aa  141  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  38.5 
 
 
298 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  34.98 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 
293 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  34.58 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  31.3 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  36.67 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  34.76 
 
 
307 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  35.71 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  33.94 
 
 
336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  34.56 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.6 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.52 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  35.43 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  34.56 
 
 
303 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  29.69 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  33.2 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  35.44 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  31.9 
 
 
301 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  34.74 
 
 
307 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  29.76 
 
 
301 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  30.57 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  31.9 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  31.9 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  31.9 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  31.9 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  35.64 
 
 
323 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  31.88 
 
 
303 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  31.47 
 
 
303 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  35.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  35.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  35.15 
 
 
307 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  35.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  35.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  35.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  35.21 
 
 
306 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  36.14 
 
 
309 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  36.14 
 
 
309 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  35.4 
 
 
320 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  36.14 
 
 
307 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
289 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
287 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  36.61 
 
 
300 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  31.13 
 
 
295 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  34.6 
 
 
296 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.49 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  32.46 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.9 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  37.75 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  30.13 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  30.26 
 
 
317 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.08 
 
 
295 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  31.6 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  32.42 
 
 
293 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  31.72 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  31.94 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  30.29 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.24 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.78 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.95 
 
 
315 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  28.04 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  30.88 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.02 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  26 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  29.36 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  30.41 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  30.24 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  29.36 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0201  hypothetical protein  28.12 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.930951  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  27.14 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  28.84 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  31.66 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  28.45 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  27.54 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  24.77 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  27.09 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>