229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2471 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  709    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.74 
 
 
290 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.3 
 
 
318 aa  288  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  48.99 
 
 
310 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.98 
 
 
312 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  35.66 
 
 
311 aa  171  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  37.36 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  35.14 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.76 
 
 
293 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 
300 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 
290 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.01 
 
 
313 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
289 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  30.85 
 
 
335 aa  133  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  31.74 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  29.49 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  32.42 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  32.08 
 
 
295 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  28.87 
 
 
299 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  30.42 
 
 
295 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  30.97 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  30.52 
 
 
301 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  30 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  30.72 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  30.97 
 
 
303 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  30.8 
 
 
298 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  30.13 
 
 
303 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  30.13 
 
 
303 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  30.13 
 
 
303 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  30.13 
 
 
303 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  30.38 
 
 
295 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  28.85 
 
 
303 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
301 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  29.49 
 
 
303 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.52 
 
 
293 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
283 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  27.92 
 
 
301 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  28.52 
 
 
317 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  31.88 
 
 
286 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  31.23 
 
 
299 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  27.05 
 
 
294 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
312 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  28.47 
 
 
298 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  29.19 
 
 
300 aa  99.4  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.47 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  26.74 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  29.43 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  28.03 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  28.08 
 
 
277 aa  97.1  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  28.03 
 
 
303 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  28.32 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  27.93 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  26.27 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  26.46 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  28.21 
 
 
288 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  30.59 
 
 
298 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  25.43 
 
 
301 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  27.76 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 
301 aa  93.6  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  28.03 
 
 
308 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 
296 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  29.27 
 
 
288 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  25.26 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  28.24 
 
 
323 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  25.26 
 
 
316 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  27.49 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.27 
 
 
295 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  27.08 
 
 
307 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
308 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  28.47 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  27.3 
 
 
294 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  27.82 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  28.62 
 
 
279 aa  87.8  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  28.36 
 
 
292 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  26.8 
 
 
293 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
297 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  26.6 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  26.6 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  26.48 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  29.45 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  29.41 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  27.11 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  24.5 
 
 
307 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  26.69 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  23.81 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  24.17 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  27.27 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  28.26 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  25.68 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  25.84 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>