More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_17660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  593  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  96.3 
 
 
297 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  76.43 
 
 
323 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  53.9 
 
 
310 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  55.81 
 
 
307 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  54.15 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.96 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  49.68 
 
 
336 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  53.29 
 
 
309 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  53.29 
 
 
309 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  54.22 
 
 
307 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  53.24 
 
 
307 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  53.4 
 
 
307 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  53.31 
 
 
307 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  51.29 
 
 
323 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  53.85 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  53.85 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  53.85 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  53.85 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  53.85 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  53.85 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  49.66 
 
 
299 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  48.14 
 
 
302 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.48 
 
 
294 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  48.79 
 
 
295 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  48.79 
 
 
295 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.08 
 
 
295 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  46.08 
 
 
295 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  46.08 
 
 
295 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  47.7 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  47.78 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.14 
 
 
291 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  40.14 
 
 
303 aa  198  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  40.14 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 
296 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  40.4 
 
 
300 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  37.59 
 
 
293 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.08 
 
 
302 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.9 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  42.57 
 
 
300 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  32.88 
 
 
301 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  33.56 
 
 
301 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  32.88 
 
 
303 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  33.22 
 
 
303 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  33.22 
 
 
303 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  33.22 
 
 
303 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  33.22 
 
 
303 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  33.22 
 
 
303 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  32.54 
 
 
303 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  32.42 
 
 
303 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  37.99 
 
 
320 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  35.42 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  31.86 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.8 
 
 
298 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.97 
 
 
301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  39.3 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  33.33 
 
 
322 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.85 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  35.71 
 
 
267 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
300 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 
283 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.94 
 
 
297 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.98 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  31.79 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.75 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  27.84 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  34.23 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.52 
 
 
308 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  33 
 
 
292 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.53 
 
 
289 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  34.14 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  28.81 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  30.61 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.59 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  35.54 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 
302 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 
308 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  29.23 
 
 
286 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  34 
 
 
299 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
292 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 
290 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  28.72 
 
 
307 aa  103  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  29.31 
 
 
288 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  32.64 
 
 
317 aa  102  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 
297 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  30.87 
 
 
311 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
301 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  27.49 
 
 
306 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  29.21 
 
 
288 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.8 
 
 
295 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  33.21 
 
 
292 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  30.95 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  30.67 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>