More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0726 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  56.27 
 
 
319 aa  317  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  52.61 
 
 
294 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.21 
 
 
312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  45.58 
 
 
303 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.7 
 
 
308 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  45.05 
 
 
301 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  45.64 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  44.71 
 
 
301 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  44.37 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  44.03 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  44.03 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  44.03 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  44.03 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  44.03 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  44.03 
 
 
303 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  42.32 
 
 
301 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.09 
 
 
301 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  43.84 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  39.43 
 
 
295 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  45.65 
 
 
296 aa  195  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.8 
 
 
301 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.64 
 
 
283 aa  176  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.25 
 
 
302 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  40.22 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  38.35 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  38.35 
 
 
295 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  37.58 
 
 
301 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.26 
 
 
343 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  36.11 
 
 
294 aa  161  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  34.95 
 
 
322 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  34.69 
 
 
298 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.79 
 
 
302 aa  159  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  35.02 
 
 
289 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.74 
 
 
293 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  32.7 
 
 
336 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  34.8 
 
 
297 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.34 
 
 
295 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  35.34 
 
 
295 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  34.8 
 
 
308 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  35.34 
 
 
295 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  32.32 
 
 
307 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.39 
 
 
294 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  31.99 
 
 
307 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  37.16 
 
 
299 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 
315 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  34.73 
 
 
323 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  32.66 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  32.66 
 
 
358 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  33.56 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.5 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  34.58 
 
 
302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  32.75 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  34.05 
 
 
288 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  34.05 
 
 
288 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
300 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.38 
 
 
289 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  34.36 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  35.36 
 
 
299 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  34.86 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.98 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  34.15 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  34.15 
 
 
302 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  34.15 
 
 
295 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  36.62 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  34.49 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  33.88 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  33.11 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  34.41 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  32.39 
 
 
292 aa  130  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  31.69 
 
 
307 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  32.53 
 
 
305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  33.22 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 
297 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  32.08 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  32.75 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  35.14 
 
 
277 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  36.68 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  34.15 
 
 
307 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
313 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  36.62 
 
 
316 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  32.04 
 
 
307 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.74 
 
 
304 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  33.45 
 
 
300 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  30.1 
 
 
306 aa  123  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  29.12 
 
 
296 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  34.16 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  32.35 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  32.35 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  32.35 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  32.35 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  32.35 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  32.35 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  32.35 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>