277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3187 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  583  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  60.76 
 
 
305 aa  345  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  60.34 
 
 
311 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  60.78 
 
 
312 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  60.85 
 
 
358 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  60.85 
 
 
316 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  60.27 
 
 
316 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  59.07 
 
 
314 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  56.74 
 
 
308 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  58.78 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  57.19 
 
 
316 aa  294  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.19 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  39.66 
 
 
299 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  35.07 
 
 
303 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  34.15 
 
 
303 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  34.15 
 
 
303 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  34.15 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  34.15 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  34.15 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  33.8 
 
 
301 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  33.8 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  33.8 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  34.15 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  34.15 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 
301 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  32.4 
 
 
319 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 
343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  29.02 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  26.67 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  31.85 
 
 
301 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  28.23 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  32.74 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  29.45 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  31.8 
 
 
286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
283 aa  110  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 
315 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 
308 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  29.24 
 
 
310 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  31.16 
 
 
294 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 
313 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
300 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  28.47 
 
 
306 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 
302 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 
292 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  26.79 
 
 
288 aa  102  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30 
 
 
292 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  30.36 
 
 
304 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  29.15 
 
 
293 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  26.91 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  31.8 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
289 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  27.56 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 
312 aa  96.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  30.45 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  27.7 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  30.03 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1621  hypothetical protein  30.95 
 
 
289 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  27.09 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.22 
 
 
252 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  29.82 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  30.18 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  30.39 
 
 
308 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  29.85 
 
 
360 aa  92  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  27.55 
 
 
277 aa  92  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  31.77 
 
 
296 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  31.56 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  31.45 
 
 
292 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  28.42 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  29.74 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  25.89 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  30.55 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
302 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  27.37 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  26.41 
 
 
302 aa  87  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  31.13 
 
 
317 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  28.1 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  28.73 
 
 
295 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  25.98 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  27.89 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.31 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  26.82 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  29.08 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  23.67 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  30.31 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>