More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3091 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  566  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.79 
 
 
315 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.82 
 
 
313 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  33.99 
 
 
299 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
283 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  35.58 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  30.56 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  30.45 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  30.56 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  30.56 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  30.45 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  30.56 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  30.56 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  30.13 
 
 
301 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  30.38 
 
 
303 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  30.2 
 
 
301 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 
301 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  32.84 
 
 
286 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  30.38 
 
 
301 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.08 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  33.78 
 
 
298 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  29.08 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  33.44 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  27.61 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  32.61 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  32.73 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  32.73 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 
296 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.47 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  32.99 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  30.58 
 
 
309 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
300 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 
289 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  30.8 
 
 
296 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.42 
 
 
292 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  32.76 
 
 
288 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  32.48 
 
 
307 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  32.48 
 
 
309 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  32.04 
 
 
292 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  32.48 
 
 
309 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.94 
 
 
290 aa  103  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.93 
 
 
295 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  32.53 
 
 
307 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  31.4 
 
 
317 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
302 aa  102  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 
308 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  29.2 
 
 
282 aa  102  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  32.11 
 
 
295 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  25.26 
 
 
307 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  27.87 
 
 
305 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  31.19 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  30.74 
 
 
299 aa  99  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  30.39 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  31.02 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  28.27 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.86 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  30.42 
 
 
288 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  30.53 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  23.88 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  30.71 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  29.47 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  29.49 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  30.85 
 
 
323 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  23.55 
 
 
307 aa  94  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 
296 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 
302 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  30.95 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  30.95 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  30.67 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  29.03 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  31.1 
 
 
308 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  26.25 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  29.82 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  26.39 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  33.09 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
302 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  29.47 
 
 
358 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  28.01 
 
 
336 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  31.21 
 
 
297 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  27.18 
 
 
296 aa  89  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  32.18 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>