199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1261 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  69.34 
 
 		 290 aa  410  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0663  integral membrane protein, putative transmembrane transporter  69.37 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  58.21 
 
 		 292 aa  328  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  59.85 
 
 		 292 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3252  hypothetical protein  47.97 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2711  hypothetical protein  45.82 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2149  hypothetical protein  39.38 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.26965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  39.58 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1683  hypothetical protein  33.56 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  27.96 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  27.96 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  28.29 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  27.91 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  27.91 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  28.29 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  28.29 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  28.29 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  28.29 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  27.52 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 294 aa  95.5  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  25.54 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 295 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  26.84 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  25.56 
 
 		 295 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  30.37 
 
 		 308 aa  92.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  24.44 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  25.28 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  28.36 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  24.07 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  26.5 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  24.82 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  26.62 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  27.93 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  25.61 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  25.26 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  23.79 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  29.17 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  25.52 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  28.9 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  29.59 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  26.52 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  29.17 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  25.26 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  24.13 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  23.31 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  27.68 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  25.75 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  24.83 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  21.28 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  25.76 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.43 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  28.82 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  25.43 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.25 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  24.31 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  25.76 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  26.17 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  25.8 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  24.63 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  23.86 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.04 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  20.57 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  23.48 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  23.86 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  23.86 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  25.29 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  25.68 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  27.34 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  29.33 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.71 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  23.59 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  22.73 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  25.19 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  25.09 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  22.73 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  22.73 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  27.27 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  22.73 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>