More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1421 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 303 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  92.74 
 
 		 303 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  70.69 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  55.91 
 
 		 296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  55.63 
 
 		 319 aa  259  6e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  44.07 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  44.01 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  40.78 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6123  hypothetical protein  40.65 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  29.35 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  33.8 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.27 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.16 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.79 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.52 
 
 		 312 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  33.44 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  30.47 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  30.47 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  29.28 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.03 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.78 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  29.75 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  29.75 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  29.75 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  29.75 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  29.8 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  29.39 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  29.39 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  30.07 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  30.34 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  29.24 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  31.1 
 
 		 288 aa  97.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  30.42 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  30.14 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  30.14 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 290 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  30.45 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 313 aa  89.4  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  31.03 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  29.25 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  29.01 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  29.1 
 
 		 309 aa  85.9  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36520  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  33.92 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  24.58 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  29.03 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  30.56 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  31.45 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  28.47 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  32.37 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  29.01 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  25 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  26.76 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  27.46 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  25.17 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  25.17 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  32.64 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  28.12 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  31.21 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  27.33 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  26.43 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  27.08 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  25.69 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  25.77 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  31.17 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  31.6 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.92 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  25.1 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3937  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.71 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000721234  decreased coverage  0.000464529 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  27.05 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  30.66 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  30.6 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  24.16 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  24.21 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  25.48 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2982  DMT family permease  32.3 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.85 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>