20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0754 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  530  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.16 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  23.99 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  20.85 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  22.22 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  23.02 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  20.61 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  22.34 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  21.71 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.66 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  20.07 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  28.36 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.05 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  21.05 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10231  integral membrane protein, DUF6  23.94 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0119953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  17.13 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  24.88 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  19.57 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>