69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0340 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  33.95 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  29.37 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  26.87 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.84 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  26.92 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  23.84 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  26.29 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.64 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  26.55 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  25.12 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  25.67 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  26.12 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  22.42 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  22.01 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.9 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.92 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  26.92 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  27.84 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.92 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  26.02 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  23.05 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  26.92 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.84 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  26.17 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  27.01 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  29.3 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.75 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  22.61 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  25.5 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  27.47 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  22.18 
 
 		 305 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  23.68 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  25.82 
 
 		 317 aa  52.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  25.18 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  26.74 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  25.78 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  19.74 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  19.92 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.47 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  25.45 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.63 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  21.63 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  23.72 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  24.03 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  24.18 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  22.71 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  19.3 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  26.02 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  26.1 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  22.67 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  22.42 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>