115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2687 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  561  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  30.86 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  30 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  31.02 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  31.64 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.37 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.31 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  30.39 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  28.87 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  31.01 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  30.35 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  29.45 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  31.64 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  31.67 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  26.32 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  31.79 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  27.78 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  29.39 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1169  hypothetical protein  25.91 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.351045  normal  0.345968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  25.77 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  25.51 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.9 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0190  hypothetical protein  21.35 
 
 		 295 aa  52.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  29.76 
 
 		 298 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  25.72 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0754  hypothetical protein  20.14 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000572396  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  28.72 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  25.81 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  27.1 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  26.79 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  32.91 
 
 		 336 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  25.59 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  36.07 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  25.68 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  27.02 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  26.34 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  26.9 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0125  hypothetical protein  21.2 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  35.25 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  27.17 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.96 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  26.9 
 
 		 294 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  35.9 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  36.13 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  28.52 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  31.64 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.52 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  36.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0129  hypothetical protein  20.85 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.31523  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  36.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  36.13 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.1 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  25.23 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05630  hypothetical protein  25.58 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0400  hypothetical protein  22.16 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  26.62 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.48 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  25.36 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  24.45 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  31.34 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  31.2 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  19.78 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  26.17 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  31.97 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  22.01 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1722  hypothetical protein  23.73 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.823171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>