135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2217 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
348 aa  681    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  63.08 
 
 
352 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.5 
 
 
347 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  58.29 
 
 
353 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.77 
 
 
356 aa  361  8e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.06 
 
 
353 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  56.12 
 
 
356 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  57.4 
 
 
356 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  57.4 
 
 
396 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  58.63 
 
 
380 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  57.4 
 
 
356 aa  330  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  61.32 
 
 
351 aa  329  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  59.23 
 
 
350 aa  329  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  58.86 
 
 
372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  57.1 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  57.1 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  57.1 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  57.1 
 
 
354 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.9 
 
 
358 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  54.96 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  54.96 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  54.96 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  61.29 
 
 
351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  59.29 
 
 
353 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  59.49 
 
 
354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  53.2 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  61.9 
 
 
318 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  53.94 
 
 
372 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  56.43 
 
 
350 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.53 
 
 
352 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  57.01 
 
 
353 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  57.01 
 
 
353 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.06 
 
 
349 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  52.06 
 
 
349 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  56.45 
 
 
357 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  53.04 
 
 
356 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  45.77 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  60.82 
 
 
352 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  48.36 
 
 
353 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  38.59 
 
 
363 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  41.06 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  40.63 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.07 
 
 
330 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.33 
 
 
347 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.6 
 
 
350 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  40.47 
 
 
350 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.01 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  41.73 
 
 
280 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  32.08 
 
 
347 aa  169  7e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.02 
 
 
351 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  35.89 
 
 
312 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.22 
 
 
302 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.42 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.22 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  58.46 
 
 
92 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  24.75 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  27.87 
 
 
331 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  26.5 
 
 
302 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  26.5 
 
 
302 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.81 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.97 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.85 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.4 
 
 
303 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  28.1 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  27.04 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  26.44 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.63 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.64 
 
 
303 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  27.04 
 
 
303 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  27.04 
 
 
303 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  27.04 
 
 
303 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  27.11 
 
 
302 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  27.04 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.64 
 
 
303 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  26.42 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  27.04 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  26.42 
 
 
301 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  26.24 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0432  hypothetical protein  22 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 
286 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.44 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  25.47 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  23.76 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.89 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  23.76 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  23.76 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.23 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  25.85 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.89 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.89 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  26.74 
 
 
302 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  29.17 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0610  hypothetical protein  22.36 
 
 
349 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00052369  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.87 
 
 
316 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  21.89 
 
 
303 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  29.25 
 
 
334 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  25.23 
 
 
299 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>