31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4940 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  183  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  63.08 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.46 
 
 		 348 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  55.38 
 
 		 380 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  52.31 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  53.85 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  53.85 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  53.85 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  53.85 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  53.85 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  53.85 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.58 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  50.77 
 
 		 353 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  53.85 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.77 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.23 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  55.38 
 
 		 372 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  56.92 
 
 		 356 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  39.44 
 
 		 363 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.62 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  44.62 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  52.31 
 
 		 353 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  52.31 
 
 		 353 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  50.77 
 
 		 372 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  45.45 
 
 		 350 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  46.15 
 
 		 346 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  56.76 
 
 		 318 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  52.31 
 
 		 350 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 330 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  52.31 
 
 		 353 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  47.69 
 
 		 354 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>