87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2574 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 358 aa  682    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  70.64 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  67.33 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  62.24 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  51.85 
 
 		 353 aa  322  6e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.66 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  52.1 
 
 		 356 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.49 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  50.56 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  53.15 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.43 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  52.24 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  51.43 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 356 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  52.23 
 
 		 356 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  52.23 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  52.23 
 
 		 356 aa  279  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  52.68 
 
 		 353 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  53.64 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  52.23 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  47.95 
 
 		 352 aa  276  6e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  51.93 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  51.93 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  50.3 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  51.3 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  49.86 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  49.86 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  49.58 
 
 		 372 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  51.51 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  51.51 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  51.45 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  52.39 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  42.23 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  52.08 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  40.52 
 
 		 363 aa  242  7e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  43.57 
 
 		 344 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  44.28 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  43.68 
 
 		 346 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.64 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  52.23 
 
 		 352 aa  222  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 350 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.38 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.09 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  49.34 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  42.11 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.56 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  36.51 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  43.17 
 
 		 280 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.2 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.69 
 
 		 351 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.92 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  36.01 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  28.72 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.43 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  57.58 
 
 		 92 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  29.9 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  29.15 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  29.48 
 
 		 313 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  26.83 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4830  hypothetical protein  27 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0481813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.78 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.15 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.22 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  27.37 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  22.07 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  26.91 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  25.66 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0433  hypothetical protein  23.66 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  22.73 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.23 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.92 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  33.59 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.18 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  27.17 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  26.55 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.9 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  30.65 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.95 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  26.04 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  22.57 
 
 		 294 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  28.26 
 
 		 309 aa  42.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>