103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2405 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  694    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.06 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  53.43 
 
 
353 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.92 
 
 
356 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.8 
 
 
353 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  55.68 
 
 
372 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  55.4 
 
 
372 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  55.4 
 
 
372 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  55.09 
 
 
356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  54.86 
 
 
372 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.33 
 
 
347 aa  320  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  54.63 
 
 
354 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  55.22 
 
 
380 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  53.41 
 
 
396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  53.41 
 
 
356 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  53.41 
 
 
356 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  58.26 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  54.22 
 
 
350 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  53.12 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  54.73 
 
 
353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  53.12 
 
 
358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  53.71 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.32 
 
 
349 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  51.32 
 
 
349 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.95 
 
 
358 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  61.36 
 
 
318 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  52.87 
 
 
350 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  56.8 
 
 
351 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  54 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  52.33 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  51.32 
 
 
349 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  52.08 
 
 
353 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  52.08 
 
 
353 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  51.27 
 
 
357 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  52.02 
 
 
356 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  52.08 
 
 
353 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.34 
 
 
352 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  43.7 
 
 
344 aa  256  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  55.75 
 
 
352 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  43.7 
 
 
346 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  40.62 
 
 
355 aa  231  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  37.57 
 
 
363 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  38.89 
 
 
350 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 
347 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.89 
 
 
350 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.91 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  37.46 
 
 
347 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.32 
 
 
323 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  39.13 
 
 
280 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  39.86 
 
 
312 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.46 
 
 
302 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 
351 aa  160  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  32.73 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  27.35 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  27.34 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  28.12 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.15 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  22.82 
 
 
309 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.47 
 
 
348 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  22.15 
 
 
309 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  29.71 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.72 
 
 
310 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  23.72 
 
 
310 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1161  hypothetical protein  28.47 
 
 
345 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  22.95 
 
 
303 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  22.71 
 
 
301 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  22.6 
 
 
303 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.14 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1167  hypothetical protein  28.47 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  23.36 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  22.6 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  22.6 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  22.26 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  22.26 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  22.26 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  25.64 
 
 
328 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  24.86 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  22.26 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  22.33 
 
 
311 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  23.36 
 
 
310 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  41.54 
 
 
92 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  24.38 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  22.81 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.16 
 
 
305 aa  46.2  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  18.57 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  21.92 
 
 
303 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  18.21 
 
 
303 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  22.43 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  29.21 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  20.71 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  26.19 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  17.92 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  23.21 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  22.6 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  23.21 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>