68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0196 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  100 
 
 		 354 aa  691    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  89.83 
 
 		 353 aa  557  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  71.75 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  75.99 
 
 		 380 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  71.84 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  75.28 
 
 		 396 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  75.28 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  75.28 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  75 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  75 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  75 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  72.47 
 
 		 372 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  73.16 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  71.34 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  71.34 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.13 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  71.34 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  64.96 
 
 		 351 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.66 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  66.17 
 
 		 351 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  59.88 
 
 		 350 aa  345  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  55.78 
 
 		 352 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.31 
 
 		 348 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  62 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  67.23 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.98 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  52.91 
 
 		 372 aa  309  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  52.91 
 
 		 372 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  52.91 
 
 		 372 aa  308  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  55.07 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  52.07 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  54.07 
 
 		 372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.93 
 
 		 347 aa  282  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.6 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  52.6 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  55.36 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  45.58 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  44.67 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  52.53 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  42.57 
 
 		 363 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  54.3 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.56 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  39.89 
 
 		 355 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.65 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.18 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.42 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  37.07 
 
 		 350 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  43.43 
 
 		 280 aa  180  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  33.96 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  34.81 
 
 		 312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.77 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  28.91 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26.84 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  52.31 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  27.8 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.03 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  37.35 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.32 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  26.39 
 
 		 336 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  45.31 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.51 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  35.44 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  23.91 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  34.94 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  34.94 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>