106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0673 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  698    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.76 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  42.86 
 
 
355 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.72 
 
 
358 aa  195  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  35.45 
 
 
344 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  32.95 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  36.14 
 
 
352 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  34.46 
 
 
372 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  34.46 
 
 
372 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  34.46 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  34.64 
 
 
346 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  30.41 
 
 
353 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  31.78 
 
 
350 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  34.14 
 
 
349 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  33.14 
 
 
372 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.27 
 
 
347 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  30.62 
 
 
372 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  32 
 
 
356 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  31.38 
 
 
350 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 
348 aa  146  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.2 
 
 
330 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.39 
 
 
356 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.07 
 
 
323 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.82 
 
 
302 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  29.86 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  33.72 
 
 
356 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  31.06 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  33.02 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  30.84 
 
 
356 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  30.84 
 
 
356 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  30.75 
 
 
396 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  29.94 
 
 
353 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  33.45 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  28.92 
 
 
353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  28.92 
 
 
353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  34.42 
 
 
351 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  28.31 
 
 
353 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  29.97 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  31.15 
 
 
356 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  30.53 
 
 
358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  30.53 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.89 
 
 
347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  33.21 
 
 
318 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  32.29 
 
 
280 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  28.25 
 
 
357 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
351 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  27.93 
 
 
312 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  33.9 
 
 
352 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  29.19 
 
 
350 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  27.87 
 
 
293 aa  87.8  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  28.24 
 
 
274 aa  62.8  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.85 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  25.26 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  23.28 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.47 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  23.64 
 
 
301 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.46 
 
 
294 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.1 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  23.11 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  21.91 
 
 
322 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  28.57 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  27.98 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  26.46 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  25.54 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  25.54 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  25.51 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  28.44 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  25.51 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  27.98 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.9 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.75 
 
 
303 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  25.25 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.78 
 
 
290 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  27.98 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  23.05 
 
 
286 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  27.98 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.28 
 
 
287 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  25.18 
 
 
294 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  24.6 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.62 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.11 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  25.65 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  27.98 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  25.67 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  27.98 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.22 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  25.09 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.85 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  24.19 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  25.85 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  23.15 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  27.06 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  27.19 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  23.05 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.49 
 
 
292 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  23.4 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.51 
 
 
309 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>