61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5765 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  90.08 
 
 		 353 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  97.73 
 
 		 372 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  90.08 
 
 		 353 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  90.08 
 
 		 353 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  90.08 
 
 		 353 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  71.14 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.75 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  76.88 
 
 		 380 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  74.63 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  74.63 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  74.63 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  73.43 
 
 		 354 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  74.33 
 
 		 356 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  74.33 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  74.33 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.9 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  64.72 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.47 
 
 		 352 aa  359  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  64.58 
 
 		 351 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.29 
 
 		 348 aa  352  5e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  54.86 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  60.18 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.56 
 
 		 358 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  63.66 
 
 		 354 aa  331  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  69.14 
 
 		 352 aa  328  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  52.92 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  56.9 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  52.92 
 
 		 372 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  52.92 
 
 		 372 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  53.31 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.58 
 
 		 347 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.12 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  52.12 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  54.47 
 
 		 372 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  46.86 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  52.27 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  53.37 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  42.32 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  39.66 
 
 		 363 aa  246  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  54.15 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  39.54 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.32 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.74 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.41 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  37.93 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  43.07 
 
 		 280 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  30.65 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.18 
 
 		 302 aa  158  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  36.75 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.45 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  28.53 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  52.31 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  23.41 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  28.99 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.85 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  27.31 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.37 
 
 		 343 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>