95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0451 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  76.68 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.67 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  38.01 
 
 		 352 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.08 
 
 		 348 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  34.29 
 
 		 363 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  37.36 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  39.59 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  39.53 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  38.35 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  38.57 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  39.74 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  38.57 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  38.57 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  39.43 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.75 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  36.75 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  39.48 
 
 		 354 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.42 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  35.38 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  38.17 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  38.17 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  38.17 
 
 		 396 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  38.9 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  35.93 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  38.51 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  37.87 
 
 		 356 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  37.8 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  37.87 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  37.87 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  39.22 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.57 
 
 		 347 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  38.02 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.19 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 352 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  37.76 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  36.08 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  36.98 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  34.18 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.96 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  35.03 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  35.03 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  37.28 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  40.94 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  39.43 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  29.85 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  30.07 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.98 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  30.2 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  26.54 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.97 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  25.56 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  25.19 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  25.37 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  25.37 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  25.37 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  22.26 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.3 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.11 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  26.67 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  29.05 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.48 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.74 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  26.67 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  27.78 
 
 		 301 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.9 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.43 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  24.3 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.9 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  24.5 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  22.97 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.09 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.9 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.74 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.9 
 
 		 303 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30.29 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  45.45 
 
 		 92 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.51 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.74 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.74 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.56 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  24.43 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  23.29 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  23.29 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.48 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  27.45 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  31.16 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.62 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  29.82 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>