60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1308 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  99.72 
 
 
356 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  99.72 
 
 
356 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  99.44 
 
 
356 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  100 
 
 
356 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  100 
 
 
358 aa  686    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  99.72 
 
 
396 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  94.66 
 
 
380 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.53 
 
 
353 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  73.6 
 
 
353 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  73.14 
 
 
356 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  76.97 
 
 
354 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  73.11 
 
 
372 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  73.95 
 
 
353 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.83 
 
 
356 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  72.84 
 
 
353 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  72.84 
 
 
353 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  72.24 
 
 
353 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  64.61 
 
 
351 aa  368  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.73 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  64.89 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.19 
 
 
348 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  54.02 
 
 
352 aa  339  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  58.81 
 
 
350 aa  339  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  60.96 
 
 
354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  68.73 
 
 
352 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.47 
 
 
358 aa  316  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  58.81 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  51.93 
 
 
372 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  51.93 
 
 
372 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  51.93 
 
 
372 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  53.24 
 
 
349 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  52.66 
 
 
349 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.66 
 
 
349 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.18 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  52.89 
 
 
372 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  52.02 
 
 
356 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  44.6 
 
 
346 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  53.95 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  54.65 
 
 
357 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  42.12 
 
 
344 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  40.62 
 
 
363 aa  232  9e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.14 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.64 
 
 
350 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  39.61 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.42 
 
 
330 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  43.8 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  38.4 
 
 
350 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  31.27 
 
 
347 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.7 
 
 
302 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  35.62 
 
 
312 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.46 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  28.04 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  25.43 
 
 
333 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  53.85 
 
 
92 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  28.66 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  29.22 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  26.99 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.41 
 
 
330 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>