74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0541 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 347 aa  681    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  61.05 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.79 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.39 
 
 		 323 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.09 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  42.9 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  43.64 
 
 		 352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  44.01 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.86 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  44.14 
 
 		 380 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.87 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  44.54 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  44.54 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  44.48 
 
 		 396 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.21 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  43.66 
 
 		 356 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  44.25 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  44.25 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  46.93 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  38.51 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  42.74 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.9 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  43.6 
 
 		 350 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  41.45 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  42.49 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  42.05 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  42.05 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  42.06 
 
 		 353 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  41.76 
 
 		 372 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  40.97 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.97 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  45.09 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  37.93 
 
 		 355 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  42.2 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  44.76 
 
 		 351 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  40.95 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  40.95 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.18 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  36.07 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  40.23 
 
 		 357 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  40.33 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  32.82 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  40.97 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  40.15 
 
 		 280 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.94 
 
 		 352 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  42.69 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  35.61 
 
 		 353 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  38.35 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  44.49 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.92 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.24 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  30.53 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.44 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26.44 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.06 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  23 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.18 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  30.53 
 
 		 307 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.73 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49268  predicted protein  25.89 
 
 		 579 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.93 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.54 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.35 
 
 		 303 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.35 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.35 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.35 
 
 		 303 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  22.88 
 
 		 303 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.35 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  22.98 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  31.36 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>