61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6184 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  92.07 
 
 		 353 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  89.8 
 
 		 372 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  90.08 
 
 		 353 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  97.45 
 
 		 353 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  70.66 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.25 
 
 		 353 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  73.13 
 
 		 396 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  73.13 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  73.13 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  74.17 
 
 		 380 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  72.84 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  72.84 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  72.84 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  71.51 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.95 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  63.56 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  63.69 
 
 		 351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.39 
 
 		 352 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.82 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  52.84 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  58.26 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  63.4 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.71 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  66.77 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  55.49 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  50.14 
 
 		 372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  50.14 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  50.14 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.14 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  51.14 
 
 		 349 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  50.43 
 
 		 349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.92 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  51.87 
 
 		 372 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  45.43 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  50.56 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  53.2 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  55.12 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  41.16 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  39.66 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  38.97 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.33 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  43.8 
 
 		 280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  36.31 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  31.56 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  37.1 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.22 
 
 		 302 aa  146  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.12 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.13 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  52.31 
 
 		 92 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  24.22 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  28.65 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  28.08 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.52 
 
 		 328 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.5 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  29.67 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>