72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2294 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
350 aa  697    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  56.56 
 
 
355 aa  388  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  47.69 
 
 
347 aa  292  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  41.74 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.57 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  43.11 
 
 
344 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  39.13 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  36.54 
 
 
353 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.76 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  36.02 
 
 
352 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.09 
 
 
348 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  37.86 
 
 
349 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  37.91 
 
 
380 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.72 
 
 
353 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  36.53 
 
 
356 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  36.24 
 
 
372 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  37.69 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  37.69 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  37.69 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.94 
 
 
347 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  37.39 
 
 
356 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  36.72 
 
 
350 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  41.67 
 
 
280 aa  193  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  37.39 
 
 
356 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  37.39 
 
 
358 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.15 
 
 
330 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  37.01 
 
 
354 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  34.93 
 
 
372 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.07 
 
 
349 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  38.07 
 
 
349 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  34.93 
 
 
372 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  34.93 
 
 
372 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  38.04 
 
 
372 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  38.66 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  35.8 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  37.57 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  37.79 
 
 
351 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  39.71 
 
 
354 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.71 
 
 
323 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  35.16 
 
 
350 aa  176  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  36.69 
 
 
357 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  34.53 
 
 
353 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  34.53 
 
 
353 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.93 
 
 
347 aa  159  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  32.84 
 
 
351 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
351 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.26 
 
 
302 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
352 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  30.54 
 
 
353 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  35.84 
 
 
312 aa  144  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  37.15 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  35.19 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  29.23 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  24.5 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  25.51 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 
311 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26.15 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  25.85 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.59 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.25 
 
 
309 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.99 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.92 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  27.17 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  24.12 
 
 
325 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  27.03 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  24.36 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  23.27 
 
 
317 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  24.57 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  23.33 
 
 
519 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  25.99 
 
 
310 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>