95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1678 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  711    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.56 
 
 
350 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  44.06 
 
 
347 aa  280  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  40.29 
 
 
363 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.23 
 
 
358 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  42.27 
 
 
344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  41.04 
 
 
352 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  40.88 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  40.29 
 
 
353 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  42.15 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.16 
 
 
356 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.23 
 
 
349 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  42.04 
 
 
350 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.88 
 
 
353 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  40.23 
 
 
349 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  40.83 
 
 
356 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  40.4 
 
 
372 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  37.24 
 
 
346 aa  203  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
348 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  38.42 
 
 
372 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  38.42 
 
 
372 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  38.42 
 
 
372 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  38.9 
 
 
356 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  39.82 
 
 
354 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  39.35 
 
 
353 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  38.58 
 
 
380 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  39 
 
 
350 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  39.13 
 
 
351 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  39.71 
 
 
356 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  39.71 
 
 
356 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  39.65 
 
 
396 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  39.41 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.87 
 
 
347 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  39.41 
 
 
358 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  39.41 
 
 
356 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  33.9 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  39.43 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  38.64 
 
 
351 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38 
 
 
352 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  38.25 
 
 
353 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  38.25 
 
 
353 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 
330 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  36.36 
 
 
357 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  40.44 
 
 
280 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 
347 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.64 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.03 
 
 
323 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  33.63 
 
 
353 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.13 
 
 
351 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  38.48 
 
 
352 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  35.79 
 
 
312 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  38.78 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  31.14 
 
 
293 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  26.1 
 
 
287 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  29.12 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  28.05 
 
 
301 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  22.98 
 
 
333 aa  56.2  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  27.85 
 
 
307 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.92 
 
 
305 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  24.83 
 
 
287 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  26.09 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.23 
 
 
293 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.02 
 
 
305 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  21.71 
 
 
303 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  21.59 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  21.59 
 
 
303 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  24.89 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  23.94 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  22.61 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  21.59 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.36 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.61 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  22.61 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  22.61 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 
348 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  25.57 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  23.55 
 
 
310 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  23.55 
 
 
310 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  23.51 
 
 
323 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  22.26 
 
 
303 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  22.26 
 
 
303 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  21.78 
 
 
303 aa  46.2  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4830  hypothetical protein  23.03 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0481813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  23.1 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  23.85 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.27 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  32.06 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 
315 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  24.91 
 
 
287 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 
314 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  23.81 
 
 
298 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.32 
 
 
297 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  26.95 
 
 
301 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  26.95 
 
 
301 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>