74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1582 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 352 aa  695    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  76.49 
 
 		 351 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.75 
 
 		 356 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  76.34 
 
 		 351 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  65.12 
 
 		 353 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.08 
 
 		 353 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  65.96 
 
 		 356 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  70.17 
 
 		 350 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  67.57 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  81.82 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  66.97 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  66.27 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  66.27 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  65.99 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  66.27 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  65.97 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  65.97 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  65.97 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  67.33 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  66.47 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  64.07 
 
 		 353 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  64.07 
 
 		 353 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.53 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  55.36 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.46 
 
 		 358 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  54.67 
 
 		 372 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  54.67 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  54.67 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  54.79 
 
 		 353 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  54.87 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  56.1 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  56.4 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.76 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  53.76 
 
 		 349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.81 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  49.13 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  57.87 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  45.22 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  44.06 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  38.81 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  51.98 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  41.04 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.38 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  38.14 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.8 
 
 		 330 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.26 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  43.48 
 
 		 280 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.38 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  32.5 
 
 		 347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  37.68 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.34 
 
 		 351 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  32.47 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  30.21 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  53.85 
 
 		 92 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2621  hypothetical protein  23.59 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.74 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.27 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  28.43 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.33 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  29.06 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  28.37 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.78 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.37 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  27.32 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  27.78 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.9 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.24 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  27.31 
 
 		 299 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  27.65 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  54.84 
 
 		 464 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  27.07 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>